Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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