Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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HOXD12P35452 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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HOXD12P35452 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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