Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 BTF3-201ENST00000335895 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ZNF343-203ENST00000381253 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC01284-201ENST00000442994 730 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RNF216-IT1-201ENST00000443837 337 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC244021.2-201ENST00000445260 529 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL606804.1-202ENST00000446347 481 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL591438.2-201ENST00000452635 691 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ADAMTS9-AS2-204ENST00000485174 573 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AP003385.2-201ENST00000524910 973 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL118558.1-201ENST00000557551 566 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC009119.1-204ENST00000561599 564 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AF001548.1-201ENST00000577048 550 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ZNF286A-214ENST00000581529 560 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC018521.6-201ENST00000584276 335 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC008759.2-201ENST00000585880 600 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 EDRF1-AS1-205ENST00000601363 712 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL137190.1-201ENST00000603288 282 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.167-201ENST00000614947 260 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC068205.4-201ENST00000637880 804 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CLK1-215ENST00000621181 1843 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms