Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms