Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP39A1-205ENST00000619708 2269 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 VNN3-201ENST00000275223 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL022068.1-208ENST00000447250 1016 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC013489.3-201ENST00000623274 517 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ARL2-SNX15V9GYD0 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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