Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 OR5AU1-204ENST00000641822 1197 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 AL604028.1-201ENST00000430643 598 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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VAX2Q9UIW0 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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VAX2Q9UIW0 HMMR-AS1-201ENST00000514724 697 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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VAX2Q9UIW0 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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VAX2Q9UIW0 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VAX2Q9UIW0 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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