Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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