Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
COG3Q96JB2 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms