Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms