Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC069234.3-201ENST00000544939 569 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC01808-203ENST00000641932 1643 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SP6Q3SY56 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SP6Q3SY56 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SP6Q3SY56 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SP6Q3SY56 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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