Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ZNF736-202ENST00000423484 7119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms