Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms