Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms