Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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