Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.8 ms