Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC018521.4-201ENST00000578239 531 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 KCNJ10-204ENST00000637644 1239 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 CASP4-201ENST00000393150 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC00678-202ENST00000534757 798 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC009021.1-201ENST00000566098 375 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AP005328.1-201ENST00000577719 681 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC104117.5-201ENST00000606195 547 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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