Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GBP5-201ENST00000370459 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ARHGAP42P5-201ENST00000548856 2936 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OR2A4-201ENST00000315453 1758 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 C18orf32-203ENST00000613385 5395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LRRC4C-202ENST00000527150 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ACTR6-201ENST00000188312 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ZNF546-207ENST00000600094 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HBS1L-202ENST00000367820 638 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 BEND6-201ENST00000370745 579 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OR2M3-201ENST00000456743 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC080129.1-201ENST00000457815 406 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC004801.2-201ENST00000468202 779 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC113208.1-201ENST00000497944 318 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RN7SL124P-201ENST00000498656 285 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC107385.1-201ENST00000507985 778 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC034232.2-201ENST00000511579 917 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 KRT18P54-201ENST00000513396 748 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC140118.1-201ENST00000539209 532 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RN7SL237P-201ENST00000580912 287 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 KCTD2-206ENST00000581589 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL137190.1-201ENST00000603288 282 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL022318.4-202ENST00000622217 591 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 IQGAP1-214ENST00000560738 3602 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 DLEU1-212ENST00000469754 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 TRPC5-201ENST00000262839 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 IDI2-201ENST00000277517 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 DNAH10-209ENST00000614082 3484 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LDB2-202ENST00000441778 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MAP3K7CL-203ENST00000341618 1855 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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