Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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