Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CALD1Q05682 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms