Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC109587.1-213ENST00000610844 652 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AL049536.1-202ENST00000623572 455 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC119674.1-221ENST00000641594 1213 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 Z96074.1-203ENST00000637685 1746 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 GABRR3-203ENST00000621172 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 CEP41-203ENST00000343969 1087 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DEFA6Q01524 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms