Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 CASP4-201ENST00000393150 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 OR5P3-201ENST00000328375 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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CASQ1P31415 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 KRT18P53-201ENST00000431919 117 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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CASQ1P31415 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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CASQ1P31415 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 LINC00678-202ENST00000534757 798 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC009950.1-209ENST00000595586 777 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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