Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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