Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3GQ9HC16 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms