Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SUDS3Q9H7L9 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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