Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC078955.1-201ENST00000547123 882 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ENOX1-AS1-201ENST00000444442 3907 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
GRIK4Q16099 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms