Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 TMEM55A-206ENST00000630164 171 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 RPS13P2-201ENST00000437890 455 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC022400.2-201ENST00000446730 866 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 RN7SL263P-201ENST00000467969 290 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC010320.5-201ENST00000619124 676 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms