Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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CNGB1Q14028 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
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