Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRSF5Q13243 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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