Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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