Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 HIVEP3-202ENST00000372584 12319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 AC112719.2-201ENST00000501239 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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