Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CYP3A43-202ENST00000312017 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 CADPS-220ENST00000613879 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 C14orf177-201ENST00000325812 1284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 Metazoa_SRP.2-201ENST00000359385 269 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 MSRB1P1-201ENST00000396851 354 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 LYSMD1-202ENST00000440902 1003 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC016683.1-201ENST00000446590 559 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 DAZAP2-210ENST00000551313 587 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 SPINT1-AS1-204ENST00000568419 629 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AF001548.1-201ENST00000577048 550 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL155P-201ENST00000581538 263 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 EDRF1-AS1-205ENST00000601363 712 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 IFT43-201ENST00000238628 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HMGB1P1B2RPK0 Z93930.2-202ENST00000418292 208 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms