Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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BIVM-ERCC5R4GMW8 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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BIVM-ERCC5R4GMW8 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 DENND2C-202ENST00000393276 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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BIVM-ERCC5R4GMW8 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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