Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
GDAP2Q9NXN4 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms