Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 ZKSCAN3-202ENST00000341464 1794 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 UAP1-202ENST00000367924 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 TBX5-201ENST00000310346 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AL451048.1-201ENST00000413328 217 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 MTAPP2-201ENST00000437063 832 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AL391361.2-202ENST00000454826 439 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 CHIAP1-201ENST00000456220 995 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 OR4C9P-201ENST00000532368 925 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 PTPRJ-AS1-201ENST00000533964 301 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC078962.3-201ENST00000545821 482 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC008770.1-206ENST00000589551 523 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 LINC01198-208ENST00000599175 560 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 Metazoa_SRP.146-201ENST00000619409 286 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AL731563.3-201ENST00000608005 3005 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 NOL4-201ENST00000261592 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 ACSL1-212ENST00000622937 4103 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 NDUFV3-201ENST00000340344 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 CLUAP1-212ENST00000576634 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 RAD9B-203ENST00000409246 2794 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 HS3ST5-202ENST00000411826 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 CD109-202ENST00000422508 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 PTAFR-202ENST00000373857 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 KAT6A-208ENST00000485568 3592 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC110926.1-201ENST00000412499 2825 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 POLR2D-203ENST00000409955 1758 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 ZEB2-205ENST00000419938 1755 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 ZSCAN9-207ENST00000531979 1601 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 RSPO2-203ENST00000517939 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 C2orf42-205ENST00000420306 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 ERG-201ENST00000288319 4919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 Z97200.1-201ENST00000606154 2045 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 ADGRB3-202ENST00000370598 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC008817.1-201ENST00000504215 1562 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC019055.1-201ENST00000432822 443 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 OR7A15P-201ENST00000449848 1009 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 RPL7AP26-201ENST00000488538 813 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 RPL4P1-201ENST00000496596 1278 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC133485.3-201ENST00000562604 262 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC138907.3-201ENST00000563937 262 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC138869.2-201ENST00000569850 262 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 MIR7162-201ENST00000611134 69 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BCL11BQ9C0K0 AC011297.1-201ENST00000620503 2110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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