Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA4CQ9C0C4 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA4CQ9C0C4 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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