Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 MACROD2-202ENST00000378058 4025 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 ANKS1B-215ENST00000549493 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 ZNF415-214ENST00000597748 2461 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AL136146.1-201ENST00000529830 1667 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 NHLRC3-201ENST00000379599 3275 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 WBP1L-201ENST00000369889 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 LRRC2-AS1-201ENST00000599511 2291 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 TPD52-213ENST00000520527 2638 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 VSIG1-202ENST00000415430 3236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC097527.1-201ENST00000437031 530 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 RPL32P3-203ENST00000506593 498 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms