Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TM6SF1Q9BZW5 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms