Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms