Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LINC02530-201ENST00000457945 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC117422.1-201ENST00000508263 379 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AP001372.3-201ENST00000530510 609 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LINC00678-202ENST00000534757 798 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 OR4F28P-201ENST00000559128 938 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 OR4F8P-201ENST00000589943 937 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC022239.4-201ENST00000602626 504 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC241377.2-202ENST00000636462 997 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 PYHIN1-202ENST00000368138 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 SYTL2-228ENST00000533892 1441 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 MIR181C-201ENST00000384881 110 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RBMY2JP-201ENST00000425544 1059 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RPL6P24-201ENST00000445338 864 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 KIF3AP1-201ENST00000454055 611 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RN7SL19P-201ENST00000462522 306 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 ENPP7P3-201ENST00000509123 241 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 NR1I3-233ENST00000515452 1093 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC129492.5-201ENST00000603489 315 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms