Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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CCDC93Q567U6 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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CCDC93Q567U6 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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CCDC93Q567U6 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CCDC93Q567U6 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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