Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CTXN3Q4LDR2 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms