Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms