Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms