Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms