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| BRD3 | Q15059 | ZRANB2-AS2-220 | ENST00000623721 | 1133 nt | TSL 5 BASIC | 7.02 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC079298.3-201 | ENST00000624941 | 977 nt | TSL 3 BASIC | 7.02 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | RMDN2-AS1-210 | ENST00000630021 | 1053 nt | TSL 5 BASIC | 7.02 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | IQCA1-202 | ENST00000309507 | 3155 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 7.02 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC010624.4-201 | ENST00000597606 | 1351 nt | BASIC | 7.02 | □□□□□ -1.29 | | |
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| BRD3 | Q15059 | C16orf62-224 | ENST00000567245 | 573 nt | TSL 5 BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC087301.1-201 | ENST00000579037 | 321 nt | TSL 3 BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC073333.2-201 | ENST00000603589 | 769 nt | BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC073218.2-202 | ENST00000605962 | 617 nt | TSL 5 BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL031777.2-201 | ENST00000611953 | 196 nt | BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | NAPG-201 | ENST00000322897 | 3548 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | PRRC1-201 | ENST00000296666 | 4699 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | NBPF12-204 | ENST00000613714 | 2701 nt | TSL 5 BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
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| BRD3 | Q15059 | CACNB4-203 | ENST00000397327 | 2112 nt | TSL 5 BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | TPTE2P2-202 | ENST00000605924 | 2113 nt | TSL 5 BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | LNPK-212 | ENST00000544803 | 7647 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC011815.2-201 | ENST00000618230 | 2021 nt | BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092724.1-201 | ENST00000624623 | 3397 nt | BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | ATP10D-203 | ENST00000504445 | 2550 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | GPR1-209 | ENST00000612892 | 2565 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | PATE1-201 | ENST00000305738 | 1527 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | TPRG1-204 | ENST00000433971 | 2296 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | STK3-216 | ENST00000523601 | 3107 nt | TSL 2 BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC022613.3-201 | ENST00000560740 | 1346 nt | BASIC | 7.01 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | SLAIN1-201 | ENST00000267219 | 2090 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | NOL4-203 | ENST00000538587 | 1979 nt | TSL 2 BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | CHD8-202 | ENST00000430710 | 7420 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | CD84-208 | ENST00000534968 | 7885 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | MBNL2-202 | ENST00000345429 | 4669 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | ACPP-202 | ENST00000351273 | 1783 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | ANK2-226 | ENST00000612754 | 6134 nt | TSL 5 BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | DCSTAMP-208 | ENST00000622554 | 1471 nt | TSL 5 BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | TGIF1-204 | ENST00000400167 | 1352 nt | TSL 3 BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | ALB-214 | ENST00000509063 | 1911 nt | TSL 5 BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | NUP37-201 | ENST00000251074 | 1203 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | DEFB106A-201 | ENST00000335186 | 303 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | DEFB106B-201 | ENST00000335479 | 316 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA70.5-201 | ENST00000365519 | 135 nt | BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | HOPX-204 | ENST00000381260 | 1141 nt | TSL 3 BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU1-46P-201 | ENST00000384425 | 164 nt | BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
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| BRD3 | Q15059 | ARL4A-205 | ENST00000404894 | 840 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | UBE2F-204 | ENST00000409953 | 924 nt | TSL 3 BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC107057.1-201 | ENST00000425763 | 319 nt | TSL 3 BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTATP6P11-201 | ENST00000428071 | 670 nt | BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00348-201 | ENST00000428761 | 948 nt | TSL 3 BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL591178.2-201 | ENST00000429191 | 461 nt | TSL 3 BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC006333.1-204 | ENST00000429396 | 648 nt | TSL 3 BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC116038.1-201 | ENST00000432250 | 408 nt | TSL 3 BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC239800.1-201 | ENST00000442049 | 719 nt | BASIC | 7 | □□□□□ -1.29 | | |