Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 BMS1P8-201ENST00000565049 1178 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC021506.1-201ENST00000581971 597 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC005495.1-201ENST00000586611 1211 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 TATDN1-220ENST00000605953 726 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 RTCA-AS1-201ENST00000421185 423 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AL162724.2-201ENST00000426157 308 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SMCO1Q147U7 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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