Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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CUL4AQ13619 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
CUL4AQ13619 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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CUL4AQ13619 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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CUL4AQ13619 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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