Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 SEL1L-201ENST00000336735 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 LINC01226-208ENST00000640623 5019 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 EEA1-201ENST00000322349 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 SH3GLB1-203ENST00000535010 6227 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 POGZ-203ENST00000368863 6054 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ATP6V1C1-201ENST00000395862 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 BIVM-ERCC5-201ENST00000602836 5143 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 COL4A6-208ENST00000538570 6528 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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