Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ZIM3-201ENST00000269834 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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