Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC173Q0VFZ6 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 OR52A1-201ENST00000328942 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 LALBA-202ENST00000549817 1243 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC233290.1-201ENST00000553021 1186 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 THSD4-AS1-204ENST00000566268 468 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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